Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
U2AF1L4Q8WU68 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L4Q8WU68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2AF1L4Q8WU68 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms