Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD2AQ8NA29 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2AQ8NA29 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms