Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMYD4Q8IYR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD4Q8IYR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD4Q8IYR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms