Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
VSTM4Q8IW00 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VSTM4Q8IW00 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms