Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
VSTM4Q8IW00 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
VSTM4Q8IW00 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
VSTM4Q8IW00 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
VSTM4Q8IW00 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
VSTM4Q8IW00 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
VSTM4Q8IW00 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
VSTM4Q8IW00 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
VSTM4Q8IW00 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
VSTM4Q8IW00 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
VSTM4Q8IW00 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VSTM4Q8IW00 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VSTM4Q8IW00 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
VSTM4Q8IW00 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VSTM4Q8IW00 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VSTM4Q8IW00 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VSTM4Q8IW00 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VSTM4Q8IW00 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
VSTM4Q8IW00 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
VSTM4Q8IW00 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
VSTM4Q8IW00 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
VSTM4Q8IW00 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
VSTM4Q8IW00 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
VSTM4Q8IW00 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
VSTM4Q8IW00 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VSTM4Q8IW00 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VSTM4Q8IW00 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VSTM4Q8IW00 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VSTM4Q8IW00 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VSTM4Q8IW00 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VSTM4Q8IW00 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VSTM4Q8IW00 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
VSTM4Q8IW00 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VSTM4Q8IW00 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VSTM4Q8IW00 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VSTM4Q8IW00 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VSTM4Q8IW00 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VSTM4Q8IW00 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VSTM4Q8IW00 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
VSTM4Q8IW00 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VSTM4Q8IW00 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VSTM4Q8IW00 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VSTM4Q8IW00 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VSTM4Q8IW00 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
VSTM4Q8IW00 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VSTM4Q8IW00 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VSTM4Q8IW00 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
VSTM4Q8IW00 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VSTM4Q8IW00 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VSTM4Q8IW00 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
VSTM4Q8IW00 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
VSTM4Q8IW00 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
VSTM4Q8IW00 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
VSTM4Q8IW00 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VSTM4Q8IW00 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VSTM4Q8IW00 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
VSTM4Q8IW00 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VSTM4Q8IW00 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VSTM4Q8IW00 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
VSTM4Q8IW00 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
VSTM4Q8IW00 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VSTM4Q8IW00 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
VSTM4Q8IW00 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
VSTM4Q8IW00 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
VSTM4Q8IW00 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
VSTM4Q8IW00 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
VSTM4Q8IW00 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
VSTM4Q8IW00 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
VSTM4Q8IW00 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
VSTM4Q8IW00 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
VSTM4Q8IW00 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
VSTM4Q8IW00 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VSTM4Q8IW00 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
VSTM4Q8IW00 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VSTM4Q8IW00 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
VSTM4Q8IW00 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
VSTM4Q8IW00 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
VSTM4Q8IW00 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
VSTM4Q8IW00 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
VSTM4Q8IW00 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
VSTM4Q8IW00 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
VSTM4Q8IW00 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
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