Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG3Q86VR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RETREG3Q86VR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RETREG3Q86VR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms