Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ANKRD40Q6AI12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD40Q6AI12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD40Q6AI12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms