Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFMBT2Q5VUG0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFMBT2Q5VUG0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFMBT2Q5VUG0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms