Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR44Q5JSH3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR44Q5JSH3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms