Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf21Q32NC0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C18orf21Q32NC0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf21Q32NC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms