Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNN3Q15417 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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