Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNN3Q15417 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNN3Q15417 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNN3Q15417 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNN3Q15417 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNN3Q15417 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNN3Q15417 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNN3Q15417 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNN3Q15417 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNN3Q15417 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNN3Q15417 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNN3Q15417 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNN3Q15417 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNN3Q15417 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNN3Q15417 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNN3Q15417 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNN3Q15417 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNN3Q15417 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNN3Q15417 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNN3Q15417 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNN3Q15417 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNN3Q15417 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNN3Q15417 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNN3Q15417 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNN3Q15417 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNN3Q15417 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNN3Q15417 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNN3Q15417 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNN3Q15417 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNN3Q15417 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNN3Q15417 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNN3Q15417 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNN3Q15417 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNN3Q15417 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNN3Q15417 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNN3Q15417 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNN3Q15417 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNN3Q15417 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNN3Q15417 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNN3Q15417 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNN3Q15417 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNN3Q15417 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNN3Q15417 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNN3Q15417 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNN3Q15417 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNN3Q15417 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNN3Q15417 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNN3Q15417 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNN3Q15417 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNN3Q15417 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNN3Q15417 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNN3Q15417 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNN3Q15417 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNN3Q15417 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNN3Q15417 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNN3Q15417 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNN3Q15417 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNN3Q15417 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNN3Q15417 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNN3Q15417 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNN3Q15417 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNN3Q15417 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNN3Q15417 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNN3Q15417 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNN3Q15417 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNN3Q15417 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNN3Q15417 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNN3Q15417 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNN3Q15417 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNN3Q15417 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNN3Q15417 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNN3Q15417 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNN3Q15417 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNN3Q15417 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNN3Q15417 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNN3Q15417 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNN3Q15417 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNN3Q15417 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNN3Q15417 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNN3Q15417 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNN3Q15417 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNN3Q15417 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNN3Q15417 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNN3Q15417 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNN3Q15417 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNN3Q15417 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNN3Q15417 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNN3Q15417 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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