Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FEN1P39748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FEN1P39748 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FEN1P39748 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FEN1P39748 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FEN1P39748 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FEN1P39748 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FEN1P39748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FEN1P39748 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FEN1P39748 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FEN1P39748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms