Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR5P32302 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms