Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA1P29973 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGA1P29973 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGA1P29973 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms