Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBL1P28749 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBL1P28749 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBL1P28749 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBL1P28749 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBL1P28749 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBL1P28749 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBL1P28749 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBL1P28749 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL1P28749 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL1P28749 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL1P28749 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBL1P28749 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBL1P28749 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBL1P28749 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBL1P28749 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBL1P28749 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBL1P28749 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBL1P28749 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBL1P28749 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBL1P28749 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBL1P28749 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBL1P28749 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms