Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A1P19634 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9A1P19634 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A1P19634 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms