Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM1P11229 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRM1P11229 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM1P11229 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms