Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB28P51157 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms