Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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