Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRB2P47870 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms