Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms