Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM193AP78312 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms