Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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TTC29Q8NA56 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TTC29Q8NA56 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TTC29Q8NA56 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TTC29Q8NA56 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC29Q8NA56 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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