Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTH4Q9UIA0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms