Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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