Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF31Q96EP0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms