RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393261.7

FBXW9-201, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXW9, Length 1,738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9-201ENST00000393261 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.96■■■■□ 3.67
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FBXW9-201ENST00000393261 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.69
FBXW9-201ENST00000393261 ABCC9O60706 1549 aa31.78■■■□□ 2.68
FBXW9-201ENST00000393261 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.44■■■□□ 2.62
FBXW9-201ENST00000393261 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.42■■■□□ 2.62
FBXW9-201ENST00000393261 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.19■■■□□ 2.58
FBXW9-201ENST00000393261 NACADO15069 1562 aa31.11■■■□□ 2.57
FBXW9-201ENST00000393261 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.95■■■□□ 2.54
FBXW9-201ENST00000393261 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.67■■■□□ 2.5
FBXW9-201ENST00000393261 SCRIBQ14160 1630 aa30.56■■■□□ 2.48
FBXW9-201ENST00000393261 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.26■■■□□ 2.43
FBXW9-201ENST00000393261 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.94■■■□□ 2.38
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FBXW9-201ENST00000393261 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.47■■■□□ 2.31
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FBXW9-201ENST00000393261 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
FBXW9-201ENST00000393261 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.28■■■□□ 2.28
FBXW9-201ENST00000393261 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
FBXW9-201ENST00000393261 SMARCA4P51532 1647 aa29.28■■■□□ 2.28
FBXW9-201ENST00000393261 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
FBXW9-201ENST00000393261 WIZO95785 1651 aa29.04■■■□□ 2.24
FBXW9-201ENST00000393261 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.93■■■□□ 2.22
FBXW9-201ENST00000393261 SMARCA2P51531 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
FBXW9-201ENST00000393261 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.86■■■□□ 2.21
FBXW9-201ENST00000393261 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
FBXW9-201ENST00000393261 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.76■■■□□ 2.19
FBXW9-201ENST00000393261 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
FBXW9-201ENST00000393261 NCAPD3P42695 1498 aa28.67■■■□□ 2.18
FBXW9-201ENST00000393261 HMGXB3Q12766 1538 aa28.65■■■□□ 2.18
FBXW9-201ENST00000393261 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.42■■■□□ 2.14
FBXW9-201ENST00000393261 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.24■■■□□ 2.11
FBXW9-201ENST00000393261 CFTRP13569 1480 aa27.94■■■□□ 2.06
FBXW9-201ENST00000393261 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.92■■■□□ 2.06
FBXW9-201ENST00000393261 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.87■■■□□ 2.05
FBXW9-201ENST00000393261 PRDM2Q13029 1718 aa27.86■■■□□ 2.05
FBXW9-201ENST00000393261 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.81■■■□□ 2.04
FBXW9-201ENST00000393261 NESP48681 1621 aa27.75■■■□□ 2.03
FBXW9-201ENST00000393261 ABCC8Q09428 1581 aa27.71■■■□□ 2.03
FBXW9-201ENST00000393261 TRIM41Q8WV44 630 aa27.64■■■□□ 2.02
FBXW9-201ENST00000393261 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.63■■■□□ 2.01
FBXW9-201ENST00000393261 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.61■■■□□ 2.01
FBXW9-201ENST00000393261 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.6■■■□□ 2.01
FBXW9-201ENST00000393261 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.52■■■□□ 2
FBXW9-201ENST00000393261 SYNJ1O43426 1573 aa27.49■■□□□ 1.99
FBXW9-201ENST00000393261 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.47■■□□□ 1.99
FBXW9-201ENST00000393261 TOP2BQ02880 1626 aa27.44■■□□□ 1.98
FBXW9-201ENST00000393261 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.42■■□□□ 1.98
FBXW9-201ENST00000393261 CUX1P39880 1505 aa27.42■■□□□ 1.98
FBXW9-201ENST00000393261 ERCC6Q03468 1493 aa27.35■■□□□ 1.97
FBXW9-201ENST00000393261 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.33■■□□□ 1.97
FBXW9-201ENST00000393261 TOPBP1Q92547 1522 aa27.28■■□□□ 1.96
FBXW9-201ENST00000393261 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
FBXW9-201ENST00000393261 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.26■■□□□ 1.95
FBXW9-201ENST00000393261 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.2■■□□□ 1.94
FBXW9-201ENST00000393261 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
FBXW9-201ENST00000393261 WDR62O43379 1518 aa27.12■■□□□ 1.93
FBXW9-201ENST00000393261 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
FBXW9-201ENST00000393261 SOGA1O94964 1423 aa27.09■■□□□ 1.93
FBXW9-201ENST00000393261 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FBXW9-201ENST00000393261 EEA1Q15075 1411 aa27.07■■□□□ 1.92
FBXW9-201ENST00000393261 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.99■■□□□ 1.91
FBXW9-201ENST00000393261 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.99■■□□□ 1.91
FBXW9-201ENST00000393261 KIF27Q86VH2 1401 aa26.97■■□□□ 1.91
FBXW9-201ENST00000393261 CUX2O14529 1486 aa26.96■■□□□ 1.91
FBXW9-201ENST00000393261 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
FBXW9-201ENST00000393261 WDR97A6NE52 1622 aa26.91■■□□□ 1.9
FBXW9-201ENST00000393261 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
FBXW9-201ENST00000393261 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.89■■□□□ 1.9
FBXW9-201ENST00000393261 IFT140Q96RY7 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
FBXW9-201ENST00000393261 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.77■■□□□ 1.88
FBXW9-201ENST00000393261 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
FBXW9-201ENST00000393261 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.76■■□□□ 1.87
FBXW9-201ENST00000393261 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.74■■□□□ 1.87
FBXW9-201ENST00000393261 KIF21BO75037 1637 aa26.71■■□□□ 1.87
FBXW9-201ENST00000393261 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.7■■□□□ 1.87
FBXW9-201ENST00000393261 IGF1RP08069 1367 aa26.7■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 GOLGA3Q08378 1498 aa26.66■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.66■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 PRXQ9BXM0 1461 aa26.65■■□□□ 1.86
FBXW9-201ENST00000393261 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 PBRM1Q86U86 1689 aa26.63■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 CUL7Q14999 1698 aa26.62■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.6■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 GRIN2BQ13224 1484 aa26.6■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.59■■□□□ 1.85
FBXW9-201ENST00000393261 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FBXW9-201ENST00000393261 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.47■■□□□ 1.83
FBXW9-201ENST00000393261 ADAMTS12P58397 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
FBXW9-201ENST00000393261 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.45■■□□□ 1.82
FBXW9-201ENST00000393261 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.44■■□□□ 1.82
FBXW9-201ENST00000393261 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
FBXW9-201ENST00000393261 CEP162Q5TB80 1403 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXW9-201ENST00000393261 SYNJ2O15056 1496 aa26.31■■□□□ 1.8
FBXW9-201ENST00000393261 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
FBXW9-201ENST00000393261 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FBXW9-201ENST00000393261 GRIN2AQ12879 1464 aa26.26■■□□□ 1.79
FBXW9-201ENST00000393261 FBLN2P98095 1184 aa26.22■■□□□ 1.79
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