Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SNX13Q9Y5W8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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