Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNTN6Q9UQ52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTN6Q9UQ52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTN6Q9UQ52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms