Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CNTN6Q9UQ52 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CNTN6Q9UQ52 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CNTN6Q9UQ52 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CNTN6Q9UQ52 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CNTN6Q9UQ52 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CNTN6Q9UQ52 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CNTN6Q9UQ52 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTN6Q9UQ52 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTN6Q9UQ52 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CNTN6Q9UQ52 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CNTN6Q9UQ52 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CNTN6Q9UQ52 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNTN6Q9UQ52 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CNTN6Q9UQ52 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CNTN6Q9UQ52 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNTN6Q9UQ52 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CNTN6Q9UQ52 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNTN6Q9UQ52 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CNTN6Q9UQ52 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CNTN6Q9UQ52 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNTN6Q9UQ52 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CNTN6Q9UQ52 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CNTN6Q9UQ52 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CNTN6Q9UQ52 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNTN6Q9UQ52 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNTN6Q9UQ52 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CNTN6Q9UQ52 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CNTN6Q9UQ52 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CNTN6Q9UQ52 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CNTN6Q9UQ52 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CNTN6Q9UQ52 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CNTN6Q9UQ52 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CNTN6Q9UQ52 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTN6Q9UQ52 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CNTN6Q9UQ52 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CNTN6Q9UQ52 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNTN6Q9UQ52 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CNTN6Q9UQ52 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CNTN6Q9UQ52 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNTN6Q9UQ52 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTN6Q9UQ52 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNTN6Q9UQ52 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNTN6Q9UQ52 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNTN6Q9UQ52 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNTN6Q9UQ52 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNTN6Q9UQ52 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNTN6Q9UQ52 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNTN6Q9UQ52 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNTN6Q9UQ52 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CNTN6Q9UQ52 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTN6Q9UQ52 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTN6Q9UQ52 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNTN6Q9UQ52 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNTN6Q9UQ52 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNTN6Q9UQ52 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNTN6Q9UQ52 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CNTN6Q9UQ52 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNTN6Q9UQ52 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTN6Q9UQ52 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNTN6Q9UQ52 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNTN6Q9UQ52 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNTN6Q9UQ52 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNTN6Q9UQ52 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNTN6Q9UQ52 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTN6Q9UQ52 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNTN6Q9UQ52 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CNTN6Q9UQ52 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTN6Q9UQ52 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNTN6Q9UQ52 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CNTN6Q9UQ52 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNTN6Q9UQ52 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CNTN6Q9UQ52 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNTN6Q9UQ52 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNTN6Q9UQ52 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNTN6Q9UQ52 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CNTN6Q9UQ52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNTN6Q9UQ52 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CNTN6Q9UQ52 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNTN6Q9UQ52 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CNTN6Q9UQ52 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNTN6Q9UQ52 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNTN6Q9UQ52 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNTN6Q9UQ52 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CNTN6Q9UQ52 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNTN6Q9UQ52 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNTN6Q9UQ52 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CNTN6Q9UQ52 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CNTN6Q9UQ52 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CNTN6Q9UQ52 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CNTN6Q9UQ52 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CNTN6Q9UQ52 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CNTN6Q9UQ52 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CNTN6Q9UQ52 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNTN6Q9UQ52 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNTN6Q9UQ52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CNTN6Q9UQ52 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CNTN6Q9UQ52 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CNTN6Q9UQ52 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms