Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCAF8Q9UPN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCAF8Q9UPN6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SCAF8Q9UPN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCAF8Q9UPN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms