Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDH10Q9P2E7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDH10Q9P2E7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDH10Q9P2E7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms