RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429120.6

LY6E-202, Transcript of lymphocyte antigen 6 family member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LY6E, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6E-202ENST00000429120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.59■■■■■ 5.85
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LY6E-202ENST00000429120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.32■■■■■ 4.69
LY6E-202ENST00000429120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.27■■■■■ 4.68
LY6E-202ENST00000429120 NACADO15069 1562 aa43.95■■■■■ 4.63
LY6E-202ENST00000429120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.85■■■■■ 4.61
LY6E-202ENST00000429120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
LY6E-202ENST00000429120 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.23■■■■■ 4.51
LY6E-202ENST00000429120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.14■■■■■ 4.5
LY6E-202ENST00000429120 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.03■■■■■ 4.48
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LY6E-202ENST00000429120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.56■■■■■ 4.4
LY6E-202ENST00000429120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.42■■■■■ 4.38
LY6E-202ENST00000429120 SCRIBQ14160 1630 aa42.24■■■■■ 4.35
LY6E-202ENST00000429120 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.18■■■■■ 4.34
LY6E-202ENST00000429120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.17■■■■■ 4.34
LY6E-202ENST00000429120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
LY6E-202ENST00000429120 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.89■■■■■ 4.14
LY6E-202ENST00000429120 NCAPD3P42695 1498 aa40.64■■■■■ 4.1
LY6E-202ENST00000429120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.45■■■■■ 4.07
LY6E-202ENST00000429120 CUX2O14529 1486 aa40.43■■■■■ 4.06
LY6E-202ENST00000429120 ERCC6Q03468 1493 aa40.43■■■■■ 4.06
LY6E-202ENST00000429120 SMARCA2P51531 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
LY6E-202ENST00000429120 SMARCA4P51532 1647 aa40.24■■■■■ 4.03
LY6E-202ENST00000429120 HMGXB3Q12766 1538 aa40.22■■■■■ 4.03
LY6E-202ENST00000429120 NESP48681 1621 aa40.08■■■■■ 4.01
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LY6E-202ENST00000429120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.7■■■■□ 3.95
LY6E-202ENST00000429120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
LY6E-202ENST00000429120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.57■■■■□ 3.93
LY6E-202ENST00000429120 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.42■■■■□ 3.9
LY6E-202ENST00000429120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.41■■■■□ 3.9
LY6E-202ENST00000429120 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.21■■■■□ 3.87
LY6E-202ENST00000429120 WIZO95785 1651 aa39.19■■■■□ 3.86
LY6E-202ENST00000429120 WDR62O43379 1518 aa39.09■■■■□ 3.85
LY6E-202ENST00000429120 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.98■■■■□ 3.83
LY6E-202ENST00000429120 TRIM41Q8WV44 630 aa38.98■■■■□ 3.83
LY6E-202ENST00000429120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.93■■■■□ 3.82
LY6E-202ENST00000429120 CFTRP13569 1480 aa38.86■■■■□ 3.81
LY6E-202ENST00000429120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
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LY6E-202ENST00000429120 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.34■■■■□ 3.73
LY6E-202ENST00000429120 IFT140Q96RY7 1462 aa38.23■■■■□ 3.71
LY6E-202ENST00000429120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
LY6E-202ENST00000429120 PRDM2Q13029 1718 aa38.19■■■■□ 3.7
LY6E-202ENST00000429120 TOPBP1Q92547 1522 aa38.13■■■■□ 3.69
LY6E-202ENST00000429120 ABCC8Q09428 1581 aa38.05■■■■□ 3.68
LY6E-202ENST00000429120 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.01■■■■□ 3.67
LY6E-202ENST00000429120 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.01■■■■□ 3.67
LY6E-202ENST00000429120 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.01■■■■□ 3.67
LY6E-202ENST00000429120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.93■■■■□ 3.66
LY6E-202ENST00000429120 ARHGEF11O15085 1522 aa37.91■■■■□ 3.66
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LY6E-202ENST00000429120 FBLN2P98095 1184 aa37.75■■■■□ 3.63
LY6E-202ENST00000429120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
LY6E-202ENST00000429120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.63■■■■□ 3.61
LY6E-202ENST00000429120 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
LY6E-202ENST00000429120 CHD1O14646 1710 aa37.61■■■■□ 3.61
LY6E-202ENST00000429120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
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LY6E-202ENST00000429120 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
LY6E-202ENST00000429120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.45■■■■□ 3.59
LY6E-202ENST00000429120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.41■■■■□ 3.58
LY6E-202ENST00000429120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
LY6E-202ENST00000429120 CUX1P39880 1505 aa37.36■■■■□ 3.57
LY6E-202ENST00000429120 WDR97A6NE52 1622 aa37.33■■■■□ 3.57
LY6E-202ENST00000429120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
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LY6E-202ENST00000429120 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.26■■■■□ 3.56
LY6E-202ENST00000429120 SYNJ1O43426 1573 aa37.21■■■■□ 3.55
LY6E-202ENST00000429120 SYNJ2O15056 1496 aa37.2■■■■□ 3.54
LY6E-202ENST00000429120 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.11■■■■□ 3.53
LY6E-202ENST00000429120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
LY6E-202ENST00000429120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
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LY6E-202ENST00000429120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.9■■■■□ 3.5
LY6E-202ENST00000429120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.49
LY6E-202ENST00000429120 GRIN2AQ12879 1464 aa36.79■■■■□ 3.48
LY6E-202ENST00000429120 NUP160Q12769 1436 aa36.68■■■■□ 3.46
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LY6E-202ENST00000429120 CEP170Q5SW79 1584 aa36.63■■■■□ 3.45
LY6E-202ENST00000429120 TOP2BQ02880 1626 aa36.63■■■■□ 3.45
LY6E-202ENST00000429120 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
LY6E-202ENST00000429120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.58■■■■□ 3.45
LY6E-202ENST00000429120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.51■■■■□ 3.44
LY6E-202ENST00000429120 SHROOM2Q13796 1616 aa36.47■■■■□ 3.43
LY6E-202ENST00000429120 JPH4Q96JJ6 628 aa36.41■■■■□ 3.42
LY6E-202ENST00000429120 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
LY6E-202ENST00000429120 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
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