Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLE1Q9NVX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLE1Q9NVX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms