Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNTNAP4Q9C0A0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP4Q9C0A0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP4Q9C0A0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms