Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL2Q969S2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL2Q969S2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms