Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH9Q86YJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH9Q86YJ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms