Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OTOP3Q7RTS5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP3Q7RTS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP3Q7RTS5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms