Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
OTOP3Q7RTS5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
OTOP3Q7RTS5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
OTOP3Q7RTS5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
OTOP3Q7RTS5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
OTOP3Q7RTS5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
OTOP3Q7RTS5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
OTOP3Q7RTS5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
OTOP3Q7RTS5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
OTOP3Q7RTS5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
OTOP3Q7RTS5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
OTOP3Q7RTS5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
OTOP3Q7RTS5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
OTOP3Q7RTS5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
OTOP3Q7RTS5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
OTOP3Q7RTS5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
OTOP3Q7RTS5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
OTOP3Q7RTS5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
OTOP3Q7RTS5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
OTOP3Q7RTS5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
OTOP3Q7RTS5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
OTOP3Q7RTS5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
OTOP3Q7RTS5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
OTOP3Q7RTS5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
OTOP3Q7RTS5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
OTOP3Q7RTS5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
OTOP3Q7RTS5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
OTOP3Q7RTS5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
OTOP3Q7RTS5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
OTOP3Q7RTS5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
OTOP3Q7RTS5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
OTOP3Q7RTS5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
OTOP3Q7RTS5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
OTOP3Q7RTS5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
OTOP3Q7RTS5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
OTOP3Q7RTS5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
OTOP3Q7RTS5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
OTOP3Q7RTS5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
OTOP3Q7RTS5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
OTOP3Q7RTS5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
OTOP3Q7RTS5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
OTOP3Q7RTS5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
OTOP3Q7RTS5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
OTOP3Q7RTS5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
OTOP3Q7RTS5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
OTOP3Q7RTS5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
OTOP3Q7RTS5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
OTOP3Q7RTS5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
OTOP3Q7RTS5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
OTOP3Q7RTS5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
OTOP3Q7RTS5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
OTOP3Q7RTS5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
OTOP3Q7RTS5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
OTOP3Q7RTS5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
OTOP3Q7RTS5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
OTOP3Q7RTS5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
OTOP3Q7RTS5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
OTOP3Q7RTS5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
OTOP3Q7RTS5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
OTOP3Q7RTS5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP3Q7RTS5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP3Q7RTS5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
OTOP3Q7RTS5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
OTOP3Q7RTS5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
OTOP3Q7RTS5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
OTOP3Q7RTS5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
OTOP3Q7RTS5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
OTOP3Q7RTS5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
OTOP3Q7RTS5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
OTOP3Q7RTS5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
OTOP3Q7RTS5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
OTOP3Q7RTS5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
OTOP3Q7RTS5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTOP3Q7RTS5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
OTOP3Q7RTS5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
OTOP3Q7RTS5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP3Q7RTS5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
OTOP3Q7RTS5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
OTOP3Q7RTS5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
OTOP3Q7RTS5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OTOP3Q7RTS5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP3Q7RTS5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP3Q7RTS5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
OTOP3Q7RTS5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
OTOP3Q7RTS5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
OTOP3Q7RTS5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms