Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN84

CCDC81, Coiled-coil domain-containing protein 81, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC81Q6ZN84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC81Q6ZN84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC81Q6ZN84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC81Q6ZN84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms