Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABRAXAS1Q6UWZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms