Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PERM1Q5SV97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERM1Q5SV97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERM1Q5SV97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms