Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX17Q15036 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX17Q15036 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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