Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4CQ08493 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms