Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPCQ03188 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPCQ03188 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms