Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2P78314 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms