Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCD1P59942 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms