Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF135P52742 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF135P52742 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF135P52742 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms