Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VAMP7P51809 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VAMP7P51809 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VAMP7P51809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms